Task 38598673
| Name | MCL1_A16_A11_r0_2-QUICO_ATM_GAFF2_NAGL_MCL1-1-6-RND5647_0 |
| Workunit | 31553764 |
| Created | 8 Apr 2026, 11:06:27 UTC |
| Sent | 8 Apr 2026, 11:06:55 UTC |
| Report deadline | 13 Apr 2026, 11:06:55 UTC |
| Received | 12 Apr 2026, 14:42:56 UTC |
| Server state | Over |
| Outcome | Computation error |
| Client state | Aborted by user |
| Exit status | 203 (0x000000CB) EXIT_ABORTED_VIA_GUI |
| Computer ID | 649646 |
| Run time | 11 min 30 sec |
| CPU time | 8 min 50 sec |
| Validate state | Invalid |
| Credit | 0.00 |
| Device peak FLOPS | 1,134.30 GFLOPS |
| Application version | ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding v1.20 (cuda1121) windows_x86_64 |
| Peak working set size | 406.29 MB |
| Peak swap size | 6.36 GB |
| Peak disk usage | 2.89 GB |
Stderr output
<core_client_version>8.2.8</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
aborted by user</message>
<stderr_txt>
13:10:26 (25184): wrapper (7.9.26016): starting
13:10:26 (25184): wrapper: running Library/usr/bin/tar.exe (xjvf input.tar.bz2)
QB_A16_A11_0.pdb
QB_A16_A11_0.xml
QB_A16_A11.inpcrd
QB_A16_A11_input.yaml
QB_A16_A11.pdb
QB_A16_A11.prmtop
QB_A16_A11_sys.xml
run.bat
run.sh
13:10:29 (25184): Library/usr/bin/tar.exe exited; CPU time 0.015625
13:10:29 (25184): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
WARNING: The script pyaml.exe is installed in 'C:\ProgramData\BOINC\slots\17\Scripts' which is not on PATH.
Consider adding this directory to PATH or, if you prefer to suppress this warning, use --no-warn-script-location.
WARNING: The scripts abfe_production.exe, abfe_structprep.exe, make_atm_system_from_amber.exe, make_atm_system_from_pdb.exe, make_atm_system_from_rcpt_lig.exe, rbfe_production.exe and rbfe_structprep.exe are installed in 'C:\ProgramData\BOINC\slots\17\Scripts' which is not on PATH.
Consider adding this directory to PATH or, if you prefer to suppress this warning, use --no-warn-script-location.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
14:07:33 (21600): wrapper (7.9.26016): starting
14:07:33 (21600): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
16:23:15 (20856): wrapper (7.9.26016): starting
16:23:15 (20856): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
20:23:11 (22432): wrapper (7.9.26016): starting
20:23:11 (22432): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
05:42:05 (20740): wrapper (7.9.26016): starting
05:42:05 (20740): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
09:03:16 (22292): wrapper (7.9.26016): starting
09:03:16 (22292): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
09:37:06 (22292): C:/Windows/system32/cmd.exe exited; CPU time 2003.375000
09:37:06 (22292): app exit status: 0x16
09:37:06 (22292): called boinc_finish(195)
10:01:29 (22132): wrapper (7.9.26016): starting
10:01:29 (22132): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
12:31:15 (21852): wrapper (7.9.26016): starting
12:31:15 (21852): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
13:06:23 (21852): C:/Windows/system32/cmd.exe exited; CPU time 2040.750000
13:06:23 (21852): app exit status: 0x16
13:06:23 (21852): called boinc_finish(195)
13:43:55 (22304): wrapper (7.9.26016): starting
13:43:55 (22304): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
17:03:56 (12532): wrapper (7.9.26016): starting
17:03:56 (12532): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
05:59:07 (20588): wrapper (7.9.26016): starting
05:59:07 (20588): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
07:15:19 (3620): wrapper (7.9.26016): starting
07:15:19 (3620): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
08:25:49 (22360): wrapper (7.9.26016): starting
08:25:49 (22360): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
13:31:54 (19744): wrapper (7.9.26016): starting
13:31:54 (19744): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
17:54:19 (16608): wrapper (7.9.26016): starting
17:54:19 (16608): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
05:57:35 (21124): wrapper (7.9.26016): starting
05:57:35 (21124): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
06:07:35 (21124): C:/Windows/system32/cmd.exe exited; CPU time 555.656250
06:07:35 (21124): app exit status: 0x40010004
06:07:35 (21124): called boinc_finish(195)
06:41:37 (22480): wrapper (7.9.26016): starting
06:41:37 (22480): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
07:21:28 (20804): wrapper (7.9.26016): starting
07:21:28 (20804): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
06:23:45 (13340): wrapper (7.9.26016): starting
06:23:45 (13340): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
07:32:19 (22072): wrapper (7.9.26016): starting
07:32:19 (22072): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
08:55:22 (20512): wrapper (7.9.26016): starting
08:55:22 (20512): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
09:11:14 (22340): wrapper (7.9.26016): starting
09:11:14 (22340): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
09:53:29 (19992): wrapper (7.9.26016): starting
09:53:29 (19992): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
10:04:51 (2828): wrapper (7.9.26016): starting
10:04:51 (2828): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
13:57:02 (7488): wrapper (7.9.26016): starting
13:57:02 (7488): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
14:25:56 (9864): wrapper (7.9.26016): starting
14:25:56 (9864): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
15:19:12 (13596): wrapper (7.9.26016): starting
15:19:12 (13596): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
16:31:51 (21812): wrapper (7.9.26016): starting
16:31:51 (21812): wrapper: running C:/Windows/system32/cmd.exe (/c call Scripts\activate.bat && Scripts\conda-unpack.exe && run.bat)
Ein Unterverzeichnis oder eine Datei mit dem Namen "C:\ProgramData\BOINC\slots\17\tmp" existiert bereits.
Warning: importing 'simtk.openmm' is deprecated. Import 'openmm' instead.
Detected memory leaks!
Dumping objects ->
..\api\boinc_api.cpp(309) : {1489} normal block at 0x00000236B91D57B0, 8 bytes long.
Data: < ] 6 > 00 00 5D B9 36 02 00 00
..\lib\diagnostics_win.cpp(417) : {309} normal block at 0x00000236B91D5010, 1080 bytes long.
Data: < U > A8 55 00 00 CD CD CD CD 8C 01 00 00 00 00 00 00
Object dump complete.
</stderr_txt>
]]>
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